国家水稻改良中心长沙分中心是国家首批启动的重要粮食作物育种创新科研平台，业务上接受国家水稻改良中心的指导。该分中心2000年由农业部批准立项，到目前为止已经过了两期的建设。项目总投资1026.16万元，其中国拨经费679万元，地方配套和单位自筹347.16万元。通过本项目的建设，我所新建了300平方米人工气候室、200平方米水稻种质资源中期库、500平方米高标准种子储存仓库、装修改造实验室1600平方米、购置了凝胶成像系统、质普分析仪等仪器设备200余台套。项目的建成极大的改善了我所的科研和办公条件，增强了水稻育种及相关配套技术的创新研发能力，拓展了研究领域，增加了研究的深度，搭建了地方所与国家所、与农业部的沟通平台。